1.民國9年4月1日創校，原名「玉里公學校」。 

2.民國11年，易名「玉里第一公學校」。 

3.民國31年4月，更名「玉里旭國民學校」。 

4.國34年臺灣光復歸復國制，改名「玉里國民學校」。 

5.民國57年實施九年國民教育，改制「玉里國民小學」。 

6.民國66年8月，設置特殊教育班（啟智班）。 

7.民國75年8月，設置玉里國民小學附設幼稚園。

8.民國81年8月，設立附設國民小學補習學校。 

9.民國83年3月，籌設永昌國民小學（後改設玉里國民小學永昌分校）。 

10.民國88年8月，永昌分校啟用，附設幼稚園搬遷至分校。 

11.民國91年11月，設置花蓮縣南區特殊教育資源中心。 

12.民國98年5月，遷校至花蓮縣玉里鎮忠智路43號。

13.民國109年，辦理百週年校慶。

校長室 張佑先校長

教務處

    教學組、註冊組、特教組

學務處

   生教組、輔導組、體育組

總務處

   文書組、出納、事務

人事室

會計室

永昌分校

補習學校

南區特教巡資中心

    行政事務組、研發管理組

  一年一班  宋雪梅老師

  一年二班  黃麗鶯老師

  二年一班  周淑惠老師

  二年二班  吳翠樺老師

  二年三班  林宇貞老師

  三年一班  高虔誠老師

  三年二班  陳碩襦老師

  四年一班  周芳姿老師

  四年二班  施垣辰老師

  五年一班  謝必強老師

  五年二班  王瑞聞老師

  六年一班  柳嘉慧老師

  六年二班  江盈憬老師

  星光一班  王思樺老師、楊淳安老師